俺は高校生探偵、工藤新一。
幼なじみで同級生の毛利蘭とトレセン学園に見学に行って、白衣を着たウマ娘の怪しげな実験現場を目撃した。
「やぁやぁ、これは高校生探偵の工藤新一君。君の噂はかねがね聞いているよ。ところでその聡明な頭脳で私の実験を手伝ってくれないか？」とヨイショされ、良い気になっていた俺は、そのウマ娘に光る薬を飲まされ、目が覚めたら…ウマ娘になっていた。
工藤新一が女体化したと読者にバレたら、「サンデーでやるな、高橋留美子に謝れ」「探偵のくせに人のアイデア盗むのか」「そもそもお前の声、早乙女乱馬じゃねーか」などと言われ、名探偵コナンのイメージが損なわれる。
背後から近づき白衣のウマ娘をシバいていた彼女の仲間の助言で正体を隠すことにした俺は、解毒薬が完成するまで、とっさに新ウマ娘「エドガーコナン」と名乗り、なぜか力を貸してくれそうな声のワタナベトレーナーの家に転がり込んだ。
ひたすら薬の完成を待つ、見た目はウマ娘、頭脳は大人、その名は、名探偵コナン。
BGM：いつものアレ